股权转让双方所订立的股权转让协议属产权转移书据，依据《中华人民共和国印花税暂行条例》第八条和所附《印花税税目税率表》第11条以及《中华人民共和国印花税暂行条例施行细则》第十六条，立据双方应各自按协议价格(所载金额)的万分之五缴纳印花税。

其中，应纳税所得额=股权转让收入-股权原值-合理费用，按“财产转让所得”缴纳个人所得税，税率为20%。

根据《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》第十一条至第十四条，平价或低价转让股权可以不缴纳或少缴纳个人所得税，但是需要主管税务机关确认。如果主管税务机关认定股权转让收入明显偏低且无正当理由，可能会核定股权转让收入，从而发生多交个人所得税的风险。

股权转让收入明显偏低的情形包括：

（一）申报的股权转让收入低于股权对应的净资产份额的。其中，被投资企业拥有土地使用权、房屋、房地产企业未销售房产、知识产权、探矿权、采矿权、股权等资产的，申报的股权转让收入低于股权对应的净资产公允价值份额的；

（二）申报的股权转让收入低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费的；

（三）申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让收入的；

（四）申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同类行业的企业股权转让收入的；

（五）不具合理性的无偿让渡股权或股份；

（六）主管税务机关认定的其他情形。

在股权转让收入明显偏低的情况下，符合下列条件的视为有正当理由：

（一）能出具有效文件，证明被投资企业因国家政策调整，生产经营受到重大影响，导致低价转让股权；

（二）继承或将股权转让给其能提供具有法律效力身份关系证明的配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人；

（三）相关法律、政府文件或企业章程规定，并有相关资料充分证明转让价格合理且真实的本企业员工持有的不能对外转让股权的内部转让；

（四）股权转让双方能够提供有效证据证明其合理性的其他合理情形。

交易双方在适用上述“正当理由”时，应与当地的税务机关做好沟通，以免产生不必要的纳税争议。

其中，年应纳税所得额=纳税年度的收入总额-不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损，但不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额；一般企业所得税税率为25%，非居民企业在中国境内未设立机构、场所的，或者虽设立机构、场所但取得的所得与其所设机构、场所没有实际联系的，其来源于中国境内所得的企业所得税税率为20%。

此时股权转让收入计入纳税年度收入总额，而为取得该股权所发生的成本计入各项扣除。

但出让方为非居民企业的，实行源泉扣缴，以支付人即股权转让的受让方为扣缴义务人。税款由扣缴义务人在每次支付或者到期应支付时，从支付或者到期应支付的款项中扣缴。

根据《中华人民共和国企业所得税法》第四十七条和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第一百二十条，平价或低价转让股权可以不缴纳或少缴纳企业所得税，但是需要税务机关的确认。若税务机关认定企业实施不具有合理商业目的的安排而减少其应纳税收入或者所得额的，有权按照合理方法调整。上述不具有合理商业目的，是指以减少、免除或者推迟缴纳税款为主要目的。

涉及到无偿转让股票的，《财政部、税务总局关于明确无偿转让股票等增值税政策的公告》第一条明确了出让方以该股票的买入价为卖出价，按照“金融商品转让”计算缴纳增值税；在受让方将上述股票再转让时，以原出让方的卖出价为买入价，按照“金融商品转让”计算缴纳增值税。

纳税人发生应税销售行为的价格明显偏低并无正当理由的，由主管税务机关核定其销售额。