与传统的成像技术相比傅立叶顯微镜可以直接观察空间频率分布。因此如今它被广泛用于例如：表面等离子体观察、光子晶体成像等。借助VirtualLab Fusion可以对完整的傅立叶显微镜系统进行建模，并将其用于单分子成像具体来说，我们演示了几种物理光学效应的影响包括每个光学界面的菲涅尔损耗和透镜孔徑的衍射。 傅立叶显微镜对单分子成像 建模用于单分子成像的完整高NA傅立叶显微镜系统特别展示了例如：菲涅尔损耗、由于孔径引起

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