2000年宁明海渊镇县辖4个镇、11个乡：城中镇、明江镇、爱店镇、海渊镇、驮龙乡、亭亮乡、寨安乡、峙浪乡、桐棉乡、那楠乡、东安乡、板棍乡、北江乡、思乐乡、那堪乡。
2003年思乐乡与海渊镇合并为海渊镇。
2003年宁明海渊镇县行政区划一览（4个镇、10个乡：城中镇、爱店镇、明江镇、海渊镇、驮龙乡、亭亮乡、寨安乡、峙浪乡、东安乡、板棍乡、北江乡、桐棉乡、那堪乡、那楠乡）
城中镇　辖：明祥、城南、中华、北斗、三华5个社区；寨密、浦瓜、北丈3个村委会
爱店镇　辖：爱店居委会；那党、堪爱2个村委会。
明江镇　辖：明江居委会；思明、布乐、凤璜、洞廊、琴岳、安馬、祥春、利江、百泉、洪江、峙利、双龙12个村委会
海渊镇　辖：正街、新西街2个居委会；海湾、思州、驮零、驮邓、那明、什八、峙丠、那六、北岩、那功、友福、那才、蔗元、三台、桐骨15个村委会。
驮龙乡　辖：船民居委会；驮龙、纳利、下州、珠连、耀达、松林、懷利、馗塘8个村委会
亭亮乡　辖：亭亮、龙关、龙旺、北宁、梅湾、山荷、安农、天西、那潭、亭乐、立新、院景、扶贫新村13个村委会。
寨安乡　辖：顺宁、那练、江逢、连罡、板祝、渠围、浦邱、安阳、板亮、下店、那雷、立门、板墩、板山14个村委会
峙浪乡　辖：峙浪、派台、思陵、洞浪、那密、钦加、洞漫、长桥、那兵9个村委会。
东安乡　辖：东安、板桂、双棒、百合、洞品、洞坡、六审、六丈8个村委会
板棍乡　辖：板棍、上松、上逢、康宁、叫隘、那克、国华、林贴8个村委会。
北江乡　辖：北江、东什、峙书、良安、那春、法奎、浦峙、林芬、北明、下间、那小11个村委会
桐棉乡　辖：桐棉街居委会；桐棉、恭敬、那旭、那却、派时、琴清、那么、那朴、板烂、板油、那马、那梨、板岸、板古、板棉、枯楠16个村委会。
那堪乡　辖：那堪街居委会；那堪、岜晓、那吝、四寨、那钱、垌平、那佳、百六、迁龙、自卫、峙内、上根、新村、浦利、南执、驮楼、垌中17个村委会
那楠乡　辖：那楠、那陶、平安、念柴、古优、那敏、驮象、岽站、板K、康峙、驮英、小平、逢留13个村委会。
2005年驮龙乡并入城中镇。
宁明海渊镇县辖4个镇、9个乡：城中镇、爱店镇、明江镇、海渊鎮、亭亮乡、寨安乡、峙浪乡、东安乡、板棍乡、北江乡、桐棉乡、那堪乡、那楠乡