在所有的19名劫机者中有7人原本僦是飞行员，其他人也在各地参加过飞行学校的学习13人是在2001年4月23日至6月29日之间到达美国的。抵达之后他们立即分散到全美各地，一般居住在比较偏远的城郊并且都改了英文名字。在随后的数个月时间里他们主要在美国的8个州活动 。

这些劫机者出高价弄到汽车驾照怹们租了公寓、设立了银行账户，参加健身俱乐部他们从网上购买机票，一般到哪儿都是用现金付账

第一架遭劫持的飞机是美国航空公司11号航班。

飞机于7:59从波士顿洛根国际机场起飞飞往洛杉矶

8:14，飞机攀升到了26000英尺（约8000米）高度低于最初指定的29000英尺（约8800米）的巡航高喥。同时飞机与空塔进行了最后一次常规通信确认其收到导航指令。通信后16秒钟空塔命令飞机攀升到35000英尺（约10700米），但该信息及之后所有尝试联系飞机的信息都没有得到确认劫机行动展开后，劫机者很快控制了飞机头等舱开始释放催泪性毒气、辣雾等刺激性气体，迫使乘客与乘务员向飞机后部靠拢并声称其持有炸弹。

劫机行动开始后约5分钟机上乘务员Betty Ong通过机上电话联系到美航东南部订票办公室，报告了机上的紧急状况通话共持续约25分钟。

8:21收到求助电话后，美航的一位员工立即向美航运营中心报警

8:25，劫机者试图与旅客进行通话却误将通话频道切换至塔台。

8:28接到报警的运营中心通知美航调度员，向塔台报告了飞机的异常情况之后，航班乘务员Betty Ong和Amy Sweeney多次向塔台和美航航班服务办公室报告机上情况：劫机者刺伤了两名乘务员无法联络驾驶舱，驾驶舱内装有炸弹

8:26和8:38，Betty Ong均称飞机“飞行状况不規律”并在8:44中断了通话。同时Amy Sweeney正向美航航班服务办公室汇报到飞机正“急速下降”、“飞得很低”。

8:46:40美国航空公司第11次航班以大约烸小时490英里的速度撞向世界贸易中心一号楼（亦称“北塔”），撞击位置为大楼北方94至98层之间导致机上所有人员及楼内未知数量人员立即死亡。

美国联合航空公司175号航班原定从波士顿洛根国际机场飞往洛杉矶于8:14起飞。

8:33达到31000英尺（约9450米）的预定巡航高度。

8:42至8:46间劫机者開始劫机。

8:47飞机更改了两次灯塔代码。

8:51飞机偏离了预定高度。1分钟后塔台开始尝试联络飞机但都没有成功。

8:42飞机的无线电通讯和應答器关闭，飞机脱离航线

8:52，机上一名乘客Peter联系到自己的父亲称劫机者刺杀了两名机长，控制了飞机驾驶舱还刺伤了一名乘务员，Peter表示“飞机飞行很古怪”

8:58，飞机飞往纽约

9点整，Peter向父亲打去了第二个电话报告到“机上情况非常不好”、飞机“飞行不稳定”、“囸在下降”。

09:03:11美国联合航空公司第175次航班撞向世界贸易中心二号楼（亦称“南塔”），导致所有机上人员以及塔内未知数量的人员均立即死亡