清华东莞创新中心（全称：东莞深圳清华大学研究院创新中心）是根据清华大学与東莞市人民政府签署的全面合作协议精神，由东莞市人民政府与深圳清华大学研究院于2013年5月签订协议共建的、以企业化方式运作的事业单位通过自主研发、成果转化、企业孵化、创业投资、技术和人才引进、科技与金融结合来促进东莞市高新技术产业发展。
 清华东莞创新Φ心恪守清华大学“自强不息厚德载物”的校训，以体制机制创新为核心整合多方资源，摸索出一条官产学研资相结合促进高科技成果转化的自主创新之路服务于东莞市区域经济的中长期发展战略，推动东莞乃至珠三角地区高新技术产业的发展和自主创新能力的提升 
 清华东莞创新中心依托深圳清华大学研究院20年来形成的创新孵化及运作经验，构建适应东莞形势和适合自身发展的自主创新孵化体系促进清华大学及国内外的科研成果在东莞产业化。孵化体系各功能板块之间相互支撑、相互融通覆盖了项目从研发投入到成果产出的全過程。2015年1月清华东莞创新中心作为深圳清华大学研究院创新孵化体系的组成部分，获得了广东省科学技术奖励最高奖-特等奖
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