位於今本溪湖公园内的慈航寺经考证，清乾隆五十八年（1793年）重修观音寺清道光七年（1827年）重修保安寺；清同治七年（1868年）重修后湖寺。从历代重修寺院的碣碑看观音寺、保安寺、后湖寺都是慈航寺的前身。看来慈航寺的历史至少有200年慈航寺定名于1928年（民国17年）3月。
經过东北沦陷和国民党占据本溪的两个时期慈航寺因失修而十分残破。1948年本溪解放后政府对慈航寺实行关闭保护措施，1960年在国民经濟十分困难的条件下，还拨款重修慈航寺使其面目一新。翌年溪湖区人民委员会公布慈航寺为区级文物保护单位。1964年从沈阳请来画工彩绘了塑像和画壁整修后的慈航寺，山门雄伟殿堂敞亮，披彩的神像给人增添几分神秘之感殿内匾额高挂，殿外花草低铺给名传古今的本溪胜境增辉不少。特别是1978年后省、市政府先后拨款计17万元，重修慈航寺使百余年的古刹更加为之一新。慈航寺堪称本溪市修複最完善的佛寺